Kemm in-nies kif ukoll it-tadam jiġu f'forom u daqsijiet differenti. Dan għaliex kull individwu għandu sett uniku taʼ varjazzjonijiet ġenetiċi—mutazzjonijiet—li jaffettwaw kif jaġixxu u jiffunzjonaw il-ġeni. Miżjuda flimkien, miljuni ta 'varjazzjonijiet ġenetiċi żgħar jagħmluha diffiċli li wieħed ibassar kif mutazzjoni partikolari se jkollha impatt fuq kwalunkwe individwu. Cold Spring Harbour Laboratory (CSHL) Professur u Howard Hughes Medical Institute Investigator Zach Lippman wera kif varjazzjonijiet ġenetiċi fit-tadam jistgħu jinfluwenzaw il-mod kif mutazzjoni speċifika taffettwa l-pjanta. Huwa qed jaħdem biex ikun jista 'jbassar l-effetti tal-mutazzjonijiet fuq varjetajiet ta' tadam differenti.
Kombinazzjonijiet differenti ta 'mutazzjonijiet jistgħu jaffettwaw id-daqs tat-tadam b'mod imprevedibbli. F'din l-immaġni, l-ewwel kolonna turi tadam mhux mutat (WT). It-tieni u t-tielet kolonni juru tadam b'mutazzjoni waħda f'reġjun tal-promotur (R1 jew R4) għall-ġene tad-daqs tal-frott SlCV3. Il-mutazzjonijiet individwali għandhom ftit effett fuq id-daqs tal-frott. Iżda l-kombinazzjoni ta 'dawn iż-żewġ mutazzjonijiet (R1 + R4) tagħti frott ferm akbar.
F'dan l-istudju, Lippman u t-tim tiegħu użaw CRISPR, għodda preċiża ħafna u mmirata għall-editjar tal-ġeni, fuq żewġ ġeni tat-tadam li jikkontrollaw id-daqs tal-frott, SlCV3 u SlWUS. Huma ġġeneraw aktar minn 60 mutant tat-tadam billi neħħew biċċiet żgħar tad-DNA fir-reġjuni promoturi, żoni qrib il-ġeni li jikkontrollaw l-espressjoni tagħhom. F'xi każijiet, mutazzjonijiet individwali żiedu d-daqs tat-tadam bi ftit. Xi pari ta 'mutazzjonijiet ma bidlu d-daqs tal-frott xejn. Ftit kombinazzjonijiet sinerġistiċi kkawżaw żieda drammatika u mhux prevista fid-daqs tal-frott. Lippman jgħid: “Il-veru Holy Grail f’dan kollu għat-tnissil tal-uċuħ tar-raba’ huwa l-prevedibbiltà. Jekk inbiddel din is-sekwenza, ser nikseb dan l-effett. Għax hemm dan il-baħar ta’ varjanti oħra li n-natura akkumulat fil-qrib tal-mutazzjoni li qed tagħmel l-inġinerija, kif ukoll imxerrda mal-ġenoma, li ħafna minnhom jistgħu jinfluwenzaw il-mutazzjoni speċifika li qed toħloq.”
Din il-firxa ta' interazzjonijiet għal kwalunkwe żewġ mutazzjonijiet timmudella l-konsegwenzi ta' mutazzjoni waħda li sseħħ fi sfondi ġenetiċi differenti. L-effett huwa komparabbli ma 'dawk misjuba f'xi mard tal-bniedem, fejn xi nies jista' jkollhom ċerti mutazzjonijiet pre-eżistenti li jipproteġuhom minn mutazzjonijiet li jikkawżaw il-mard.
Lippman u t-tim tiegħu se jkomplu jikkwantifikaw kif mutazzjonijiet individwali u kkombinati jaffettwaw ċerti karatteristiċi tal-għelejjel. S'issa, kejlu l-interazzjonijiet bejn żewġ mutazzjonijiet individwali, iżda l-ġenomi għandhom miljuni ta 'varjazzjonijiet. Lippman jittama li jistudja biżżejjed interazzjonijiet li jistgħu jitkejlu biex jagħmlu t-tnissil aktar prevedibbli u effiċjenti.
Għal aktar informazzjoni:
Laboratorju tal-Kbir tar-Rebbiegħa tal-Port
www.cshl.edu