Hekk kif il-Virus tal-Frott Rugose Brown Brown jinfetta pjanti tat-tadam u l-bżar madwar id-dinja, il-kumpaniji taż-żerriegħa qed jaħdmu fuq it-trobbija ta 'tadam reżistenti.
Riżorsi ġenetiċi u ġenomiċi sinjuri kienu disponibbli għal dawk li jrabbu t-tadam anke qabel il-bidu tal-proġetti ta 'sekwenzar ġenomiku tat-tadam. Kollezzjonijiet kbar ta ’ġermoplasma tat-tadam ilhom stabbiliti f’diversi lokalitajiet. Aktar minn 75,000 adeżjoni tat-tadam huma kkonservati f'ġenebanks madwar id-dinja. Wieħed mill-akbar huwa l-bank tal-ġenb tal-USDA f'Ġinevra, NY.
Is-sekwenzjar tal-ġenoma tat-tadam inbeda fl-2005 bħala sforz multinazzjonali bejn 14-il pajjiż u tlesta fl-2012. Dawn l-isforzi ġew aċċellerati ħafna bl-applikazzjoni ta ’intelliġenza artifiċjali, tagħlim bil-magni u algoritmi avvanzati biex jiġu analizzati kwantitajiet kbar ta’ dejta ġenetika u fenotipika.
Pan-Ġenoma tat-tadam
Riċerkaturi mill-Istitut Boyce Thompson fl-2020 ħolqu ġenoma ta 'referenza ta' kwalità għolja għat-tadam selvaġġ biex jipproduċu pan-ġenoma tat-tadam aktar kompleta u utli. Huma skoprew sezzjonijiet tal-ġenoma li huma l-bażi tat-togħma, id-daqs u l-maturazzjoni tal-frott, it-tolleranza tal-istress u r-reżistenza għall-mard. Grazzi parzjalment għal teknoloġiji avvanzati ta 'sekwenzar li jistgħu jaqraw biċċiet twal ta' DNA, il-ġenoma ta 'referenza hija aktar kompluta u preċiża mid-database eżistenti.
Teknoloġiji ta 'sekwenzar anzjani li jaqraw biċċiet iqsar ta' DNA jidentifikaw mutazzjonijiet fil-livell ta 'bażi waħda. Madankollu, mhumiex tajbin biex isibu varjanti strutturali bħal inserzjonijiet, tħassir, inverżjonijiet jew duplikazzjonijiet ta 'biċċiet kbar ta' DNA.
Fl-2019, grupp internazzjonali ta 'riċerkaturi bnew pan-ġenoma tat-tadam bl-użu ta' sekwenzi tal-ġenoma minn 725 varjetajiet rappreżentattivi filoġenetikament u ġeografikament. Din id-database tinkludi 4,873 ġene li ma nstabux fil-ġenoma ta 'referenza oriġinali. Analiżi tal-varjazzjoni preżenti / assenti wrew telf sostanzjali tal-ġene u għażla negattiva intensa ta 'ġeni u promoturi waqt it-titjib tad-domestikazzjoni u t-tadam.
Aqra l-artiklu sħiħ fuq www.seedworld.com.